廈門自貿區兩岸貿易中心核心區包括東渡集裝箱港區、象嶼保稅區、象嶼保稅物流園區，簡稱“三區”。實現“三區”的卡口集約、物流集中、資源集中；實現卡口智能化、標準化、一體化，提高卡口效能，促進物流順暢，提高海關通關效率；通過三區整合，實現電子圍網，利用有限的土地資源，有效盤活監管空間；實現港中路貫通，由南、北卡口對接海滄大橋、杏林大橋出島，減輕疏港路運輸壓力。